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Investigadores de los NIH realizan primer estudio genómico de la diversidad fúngica de la piel humana

23/05/2013 11:59 0 Comentarios Lectura: ( palabras)

Ubicación en la superficie del cuerpo determina la composición fúngica con la mayor diversidad en los pies

Mientras que los seres humanos han aprovechado el poder de la levadura para fermentar pan y cerveza, la función de la levadura u otros tipos de hongos que viven en y sobre el cuerpo humano no se entiende bien. En el primer estudio de la diversidad fúngica de la piel humana, los Institutos Nacionales de Salud de los investigadores secuenciaron el ADN de los hongos en los sitios de la piel de los adultos sanos para definir las poblaciones normales a través de la piel y proporcionar un marco para la investigación de enfermedades de la piel por hongos.Superficies de la piel humanos son ecosistemas complejos de microorganismos, incluyendo hongos, bacterias y virus, que se conocen colectivamente como el microbioma piel. Aunque las infecciones micóticas de la piel afecta a unos 29 millones de personas en los Estados Unidos, los hongos pueden ser lentos y difíciles de cultivar en el laboratorio, lo que complica el diagnóstico y tratamiento de enfermedades de la piel hasta los hongos más comunes, como infecciones de uñas de los pies.El equipo de investigación del Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (NHGRI) y el Instituto Nacional del Cáncer (NCI), las dos partes del NIH, extendió su reciente estudio de la secuenciación del genoma de bacterias de la piel, mediante técnicas de secuenciación de ADN optimizados para la identificación de los hongos. El estudio aparece en el 22 de mayo 2013 primera edición en línea de Nature.Los investigadores encontraron que un solo tipo de hongo, que pertenece al género Malassezia, es predominante en la cabeza y el tronco. Las manos, que albergan una gran diversidad de bacterias, son el hogar de relativamente pocos tipos de hongos. En contraste, los pies, incluyendo las uñas, zapatos de tacón y webs dedo del pie contienen gran diversidad.imageLa imagen muestra un folículo piloso en la piel rodeada por bacterias y hongos bajo un microscopio de fluorescencia. Las muestras se obtuvieron a partir de la piel en la parte posterior de un participante en el estudio. Los hongos aparecen de color azul-verde, las bacterias parecen celdas de color rosa y de la piel y el cabello se ven amarillos. Fuente: Sci Med Transl 5, 172ra21 (2013) DOI: 10.1126/scitranslmed.3004925."La aplicación de la secuenciación del ADN para el estudio de los hongos de la piel es la progresión natural en la comprensión de la vida microbiana que co-existe en nuestro cuerpo", dijo el director científico NHGRI Daniel Kastner, MD, Ph.D. "Junto con la reciente secuenciación del genoma para definir la diversidad bacteriana, el análisis de la diversidad fúngica proporciona una imagen microbioma humano más completo.""Las comunidades de hongos ocupan nichos complejos, incluso en el cuerpo humano", dijo Heidi Kong, MD, co-autor principal e investigador en la rama de Dermatología del Centro del NCI para la Investigación del Cáncer. "Al obtener un conocimiento más completo de los ecosistemas de hongos y bacterias, podemos tratar mejor las enfermedades cutáneas asociadas, incluyendo enfermedades de la piel que pueden estar relacionados con el tratamiento del cáncer."Los investigadores recogieron muestras en 14 sitios del cuerpo de 10 adultos sanos. Secuenciación de los hongos en las muestras de ADN identifica fragmentos de ADN, llamado marcadores filogenéticos, que se pueden contar y se utilizan para distinguir un tipo de hongo de otra. Los esfuerzos de secuenciación generaron más de 5 millones de marcadores, a partir de las muestras, lo que representa más de 80 tipos de hongos, o géneros. Por el contrario, los métodos de cultivo tradicionales producen 130 colonias de hongos que representaban sólo 18 géneros de hongos.En el 20 por ciento de los participantes en el estudio, los investigadores observaron problemas como el talón y la punta de escala Web o cambios uña compatibles con posibles infecciones por hongos. Desde el análisis de la secuenciación del genoma, los investigadores encontraron que los diferentes individuos con infecciones del sitio talón tienen las comunidades de hongos comunes en ese sitio, mientras que aquellos con infecciones de uñas de los pies muestran tremendamente diferentes comunidades de hongos."La secuenciación del ADN revela la gran diversidad de hongos, incluso aquellos que son difíciles de crecer en la cultura", dijo Julie Segre, Ph.D., co-autor principal e investigador senior de NHGRI Genética y Biología Molecular Rama. Su especialidad es el desarrollo de la tecnología de secuenciación del ADN microbiano. "La secuenciación del ADN nos permitió aprender muchísimo más sobre la que predominan los hongos como parte del microbioma de la piel humana."Los investigadores identificaron los hongos a partir de dos filos, Ascomycetes y Basidiomycetes, como parte del censo de hongos normal en los 14 sitios de la piel. El género más común Malassezia estuvo presente en 11 de los 14 sitios de muestreo en el cuerpo. Los investigadores encontraron hongo Malassezia en cada superficie de la piel de voluntarios sanos, ya sea en la parte posterior de la cabeza, detrás de las orejas, en la nariz y en los talones. Heels eran también el hogar de muchos hongos adicionales, incluyendo los géneros Aspergillus, Cryptococcus, Rhodotorula y Epicoccum."Secuencia de los métodos basados ​​en ADN de identificación nos permitió diferenciar entre las especies de hongos y para la conclusión de que la diversidad de los hongos es muy dependiente de la parte del cuerpo en lugar de la persona que se toman muestras, " dijo el Dr. Kong. Un dermatólogo, el Dr. Kong explicó por qué se eligieron estos sitios para la exploración: "Nuestro estudio se centró en las áreas de la piel donde normalmente encontramos con enfermedades de la piel que se han asociado con los hongos."El sitio más complejo, el talón, es el hogar de cerca de 80 tipos de género a nivel de los hongos. Los investigadores encontraron cerca de 60 tipos de uñas muestras de hisopo y 40 tipos de muestras de las telas de los dedos de los pies.Los sitios con diversidad de hongos moderada están dentro de la curva de la mano dentro de la palma de la mano y del antebrazo, con cada ubicación de apoyo 18 a 32 géneros de hongos. Sorprendentemente, la cabeza y partes del cuerpo tronco - incluyendo la espalda, parte posterior del cuello, en el interior de las orejas, detrás de las orejas, y entre las cejas - muchos menos tipos de hongos, con sólo dos géneros y 10 cada uno.El equipo de investigación comparó los datos de la diversidad de hongos con las bacterias de la piel sobre los mismos adultos sanos. Encontraron que mientras que los brazos tienen altas medidas de diversidad bacteriana, tienen menor diversidad fúngica. Ellos encontraron lo opuesto a ser cierto para los sitios en los pies. Sitios corporal no tenían ni una alta diversidad bacteriana ni la diversidad fúngica alta. Los investigadores habían demostrado previamente que la diversidad bacteriana se puede predecir en función de si la piel está húmeda, seca o grasa. La diversidad de hongos, en cambio, parece depender de donde un sitio de la piel en particular está en el cuerpo.Los investigadores observaron, además, que existe una mayor similitud en la estructura de la comunidad de hongos en los lados izquierdo y derecho del cuerpo de la misma persona en comparación con las mismas partes del cuerpo en cualquiera de los dos individuos. Comunidades fúngicas también parecen ser bastante estables en el tiempo, con pocos cambios en las pruebas en dos ocasiones, hasta tres meses de diferencia."Los datos de nuestro estudio nos da una línea de base sobre las personas normales que no teníamos antes", dijo el Dr. Segre. "La conclusión es que los pies están llenos de diversidad fúngica, así que lleve sus chancletas en los vestuarios si usted no quiere mezclar los hongos de los pies con la de otra persona hongos."Para las imágenes de microscopio de fluorescencia de los hongos en la piel, vaya a http://goo.gl/eJakd .NHGRI es uno de los 27 institutos y centros de los NIH, una agencia del Departamento de Salud y Servicios Humanos. La División de Investigación Intramural NHGRI desarrolla e implementa tecnología para comprender, diagnosticar y tratar las enfermedades genómicas y genéticas. Información adicional sobre NHGRI se puede encontrar en su página web, http://www.genome.gov .Instituto Nacional del Cáncer dirige el Programa Nacional del Cáncer y el esfuerzo de NIH para reducir drásticamente la carga del cáncer y mejorar las vidas de los pacientes con cáncer y sus familias, a través de la investigación de la prevención y de la biología del cáncer, el desarrollo de nuevas intervenciones y la capacitación y tutoría de nuevos investigadores . Para obtener más información sobre el cáncer, visite el sitio web del NCI en http://www.cancer.gov o llame al Servicio de Información sobre el Cáncer del NCI al 1-800-4-CANCER (1-800-422-6237).El Fondo Común de NIH fomenta la colaboración y apoya una serie de excepcionalmente alto impacto, los programas de trans-NIH. Programas de los Fondos Comunes clase está diseñada para grandes oportunidades y brechas en la investigación biomédica que ningún Instituto NIH podría enfrentar solo, sino que el organismo en su conjunto pueden tratar de hacer el mayor impacto posible sobre los avances de la investigación médica. Información adicional sobre el Fondo Común de NIH se puede encontrar en http://commonfund.nih.gov . Acerca de los Institutos Nacionales de Salud (NIH): NIH, la agencia de investigación médica de la nación, incluye 27 institutos y centros y es un componente del Departamento de Salud y Servicios Humanos de los EE.UU.. NIH es la principal agencia federal realización y apoyo de la investigación médica básica, clínica y traslacional, e investiga las causas, tratamientos y curas para las enfermedades comunes y raras. Para obtener más información sobre los NIH y sus programas, visite http://www.nih.gov . Acerca de los Institutos Nacionales de Salud (NIH): NIH, la agencia de investigación médica de la nación, incluye 27 institutos y centros y es un componente del Departamento de Salud y Servicios Humanos de los EE.UU.. NIH es la principal agencia federal realización y apoyo de la investigación médica básica, clínica y traslacional, e investiga las causas, tratamientos y curas para las enfermedades comunes y raras. Para obtener más información sobre los NIH y sus programas, visite www.nih.gov .NIH ... Transformación de Descubrimientos En Salud ®

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Autor:
Modesto Rodriguez (23815 noticias)
Fuente:
antillas1.blogspot.com
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Reportaje
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